Hauptanwendungsgebiet der Moxibustion sind vor allem chronische Erkrankungen, wie z.B. chronische Bronchitis, chronisches Asthma bronchiale, chronische Diarrhö, Depressionen, Hypotonie, Kältegefühl im Körper, Schwächezustände nach akuten Erkrankungen und Erschöpfungszustände. Die Moxibustion wird oft in Verbindung mit Akupunktur angewendet.
Mehrere positive Auswirkungen auf den Organismus entstehen durch die Moxibustion. Die Stoffwechselaktivität und die Gewebsdurchblutung wird stimuliert. Organfunktionen werden zudem reflektorisch angeregt, die Fließeigenschaft des Blutes verbessert, Zunahme der weißen und der roten Blutkörperchen und eine höhere Kapazität bei der Produktion von Antikörpern stimuliert. Zusätzlich hat es eine beruhigende Wirkung auf den Geist.